高等研究院の研究スペースと運営本部は、2004年より高等総合研究館(PDF)
（Institute for Advanced Research Hall）に確保されている。

　「世界に卓越した研究成果の達成および既存領域を超える新たな学問分野の創造を目指し、本学の教員が独創的な研究プロジェクトを推進する場を提供し、もって本学の学術研究の飛躍的な向上および活性化を図る」ための施設として位置づけられている。これらの趣旨に鑑み、本院 が、建物全体の利用方法や維持管理の基本方針を示す役割を担っている。

　また、本館の有効利用を全学的に促すために、IAR Hallの利用希望者を定期的、ないしは不定期的に募集し、高等研究院会議による厳正な審査を経て入居者を決定している。

　この建物を基盤として各入居者と連携・協力し、高等研究院と本館の運営指針の改善と新たな方向付けを行うだけではなく、新たな学術分野の創案や新学際分野の創出、および現行の卓越した本学研究プロジェクトの強力な推進を支援する。